Quel logiciel de comptabilité pour un consultant indépendant ?

Le critère qui élimine la moitié de ce comparatif n’est ni le prix ni l’ergonomie : c’est votre premier client étranger. Indy écrit noir sur blanc dans sa propre documentation qu’il ne suit pas les comptes en devises étrangères. Abby réserve la facturation en devise à son plan le plus cher. Si vous facturez un client suisse, britannique ou américain, le choix se réduit brutalement.

Deuxième critère, plus discret mais plus coûteux : la façon dont vous refacturez vos frais de mission. Un train, une nuit d’hôtel et un déjeuner client ne se traitent pas de la même manière selon que la dépense a été engagée à votre nom ou à celui de votre client. L’écart porte sur la TVA, et aucun comparatif en ligne ne l’explique.

Cet article affiche les prix relevés sur les pages officielles le 29 juillet 2026, et traite quatre points que le reste de la première page ignore : les débours, l’autoliquidation intracommunautaire, le suivi de rentabilité par mission, et le moment où votre régime fiscal disqualifie la moitié des outils.

La réponse en 30 secondes

Votre situation	Le logiciel à retenir	Prix	Pourquoi
Vous démarrez, au micro-BNC	Abby (plan gratuit, puis Start)	0 à 9 € HT/mois	Facturation illimitée, suivi du seuil, aucune liasse à produire
BNC à la déclaration contrôlée	Indy Premium	28 € HT/mois (22 € en annuel)	Produit et télétransmet la 2035
Société à l’IS (SASU, EURL)	Pennylane Premium	79 € HT/mois	Comptabilité d’engagement, liasse en EDI, analytique par mission
Clients étrangers, facturation en devise	Pennylane	dès 7 € HT/mois	Le seul du comparatif à convertir automatiquement
Vous ne voulez rien faire vous-même	Un expert-comptable en ligne	dès 79 € HT/mois	La DES et les cas limites sont traités pour vous

Une précision avant d’entrer dans le détail, parce qu’elle fait gagner du temps à beaucoup de monde : si vous êtes en portage salarial, vous n’avez aucun logiciel de comptabilité à acheter. L’article L1254-1 du Code du travail fait de vous un salarié de l’entreprise de portage, qui vous rémunère. La comptabilité, les déclarations et le compte d’activité relèvent d’elle, pas de vous. Le reste de cette page ne vous concerne que si vous envisagez de quitter le portage.

Ce qui change pour un consultant indépendant

C’est la partie que les comparatifs sautent, alors que c’est elle qui décide. Quatre spécificités du métier, chacune vérifiée à sa source.

Vos frais de mission ne se refacturent pas comme vous le croyez

Vous avancez un billet de train, une nuit d’hôtel, une location de salle. Vous les refacturez à votre client. Question simple, réponse à deux branches : devez-vous ajouter de la TVA sur cette ligne ?

Tout dépend du régime de la somme. Le Code général des impôts en distingue deux, et l’écart n’est pas cosmétique.

Les frais refacturés sont dans votre base de TVA. L’article 267, I-2° du CGI y range « les frais accessoires aux livraisons de biens et prestations de services, tels que commissions, intérêts, frais d’emballage, de transport et d’assurance demandés aux clients ». Vous avez acheté le billet à votre nom, vous le refacturez : c’est du chiffre d’affaires, avec TVA au taux de votre prestation.

Les débours en sont exclus. Le même article, au II-2°, écarte de la base « les sommes remboursées aux intermédiaires qui effectuent des dépenses au nom et pour le compte de leurs commettants ». Mais il y met trois conditions cumulatives, et c’est là que presque tout le monde se trompe.

Dit autrement : réserver un hôtel avec votre carte bancaire et le refacturer « à l’euro près » ne fait pas un débours. C’est un frais refacturé mal nommé.

Ce que ça change pour votre logiciel : il doit savoir enregistrer une somme sans la compter en produit, et l’exclure de votre chiffre d’affaires. Tous ne le font pas proprement, et sur un consultant qui facture 8 000 € de frais de déplacement par an, l’erreur se voit à la première déclaration de TVA. Nos notes de frais d’un indépendant détaillent le versant justificatifs.

Votre premier client étranger change votre facture, et parfois votre logiciel

Vous décrochez une mission avec une société belge, luxembourgeoise ou allemande. Trois choses changent d’un coup.

La TVA disparaît de votre facture. L’article 259, 1° du CGI situe le lieu d’imposition d’une prestation de services chez le preneur lorsque celui-ci est assujetti. Votre client belge autoliquide donc la taxe chez lui. Vous facturez hors taxe, avec la mention « Autoliquidation » et les deux numéros de TVA intracommunautaire, le vôtre et le sien.

Une déclaration mensuelle apparaît. L’article 289 B, III du CGI impose un état récapitulatif des clients à qui vous avez fourni des services dont ils sont redevables de la taxe dans un autre État membre. C’est la déclaration européenne de services, la DES. Elle est mensuelle et dématérialisée.

Hors Union européenne, c’est plus simple. Un client établi aux États-Unis ou en Suisse sort du champ de la TVA française, et aucune DES n’est due : elle ne concerne que l’intracommunautaire.

Et si le client paie en dollars ou en livres, un second problème se pose. Indy le dit lui-même, dans sa base d’aide :

« Indy n’est pas adapté pour synchroniser les comptes bancaires en devises étrangères. »

C’est un aveu utile, et il tranche. Chez Abby, la facturation en devise est réservée au plan Business, à 33 € HT par mois. Pennylane convertit automatiquement au taux du jour, avec une réserve : une facture ne peut porter qu’une seule devise. Pennylane pose d’ailleurs sa propre limite, tout aussi franchement : « Pennylane gère uniquement la comptabilité française », les entités étrangères ne sont pas prises en charge.

Le régime fiscal qui disqualifie la moitié des outils

C’est le tri le plus brutal, et il ne se voit sur aucune page produit.

Au micro-BNC, vous n’avez pas de comptabilité à tenir. Un livre des recettes suffit. Le plafond est de 83 600 € pour 2026, avec un abattement forfaitaire de 34 % (article 102 ter du CGI). Presque tous les outils du marché conviennent, y compris les gratuits.

À la déclaration contrôlée, vous produisez une liasse 2035. Là, le champ se vide : Indy la produit et la télétransmet dès son plan Premium, Pennylane à partir de son plan Premium, et les autres vous renvoient vers un cabinet.

En société à l’impôt sur les sociétés, vous basculez en comptabilité d’engagement avec bilan et compte de résultat. Abby sort du jeu, et le dit lui-même : son outil est construit pour la micro-entreprise, et passer en SARL, SAS, SASU ou EURL suppose de changer de logiciel.

Méfiez-vous ici des contenus périmés, ils sont nombreux sur cette requête. Plusieurs pages encore en ligne annoncent une franchise de TVA à 36 800 €, valeur de 2023, dont une fiche pratique d’un éditeur qui se contredit lui-même d’une page à l’autre. Un comparateur bien positionné évoque un « abattement de 2/3 » au micro-BNC : c’est 34 %, il a confondu avec le résultat imposable. Un assureur cite encore l’EIRL parmi les statuts possibles, alors que ce statut n’existe plus depuis février 2022.

TJM, régie ou forfait : ce que votre outil doit savoir calculer

Un consultant ne vend pas un produit, il vend du temps ou un résultat. Trois modes de facturation coexistent, et ils n’ont pas les mêmes exigences comptables.

En régie, vous facturez un taux journalier multiplié par les jours réellement prestés. Le document pivot est le compte rendu d’activité, que votre client valide en fin de mois. En forfait, vous vendez un livrable à prix fixe : votre marge dépend entièrement du temps que vous y passez, et personne ne la calcule à votre place. En abonnement, vous facturez une somme récurrente, et le sujet devient la relance automatique des impayés.

C’est là qu’un critère rarement testé prend son sens : la capacité à rapprocher le temps passé du montant facturé, mission par mission. Pennylane le fait via son module analytique, à partir de son plan Essentiel. Abby et Tiime proposent un suivi de temps. Indy ne documente pas la fonction. Aucun comparatif de la première page ne l’a vérifié, alors que c’est le seul moyen de savoir si votre forfait à 6 000 € vous a rapporté un TJM de 700 € ou de 280 €.

Le comparatif, prix réels compris

Les tarifs qui circulent sur cette requête sont un champ de ruines. Le même Freebe est annoncé à 9,99 €, 10,40 €, 12,50 €, 15 € et 19 € selon les pages. Le même Indy apparaît à « 5,99 $ », 9 €, 12 €, 14 €, 24 € et 29 €. Voici les prix relevés sur les pages officielles le 29 juillet 2026, hors taxes.

	Indy	Pennylane	Abby	Tiime	Freebe
Plan gratuit	✅ Essentiel	✅ Micro (≤ 1 200 factures/an)	✅ Basique	✅ Free	❌ (essai 30 j)
1er plan payant	12 €/mois (9 € en annuel)	7 €/mois	9 €/mois	17,99 €/mois	15 € TTC/mois
Plan supérieur	Premium 19 à 59 € selon structure	Premium 79 €	Business 33 €	Business 24,99 €	—
Déclaration 2035	✅ Premium 28 €	✅ Premium 79 €	❌	🟡 via cabinet	❌
Comptabilité société à l’IS	✅ Premium 59 €	✅	❌	🟡	❌
Facturation en devise étrangère	❌ (aveu éditeur)	✅ taux du jour	🟡 plan Business	⚠️ non documenté	⚠️ non documenté
Autoliquidation intra-UE	✅	✅	✅	✅	⚠️ non documenté
Télétransmission de la DES	❌	❌	❌	❌	❌
Rentabilité par mission	⚠️ non documenté	✅ analytique (Essentiel)	✅	✅	✅
Plateforme agréée e-facture	✅	✅	✅	✅	❌ solution compatible

Tiime et Freebe ne sont pas nos partenaires, et nous ne touchons aucune commission sur eux. Nous les incluons parce qu’un comparatif limité aux produits rémunérateurs ne vaut rien.

Une ligne mérite qu’on s’y arrête, parce qu’elle vaut pour votre conformité de septembre. Freebe n’est pas une plateforme agréée. Nous avons vérifié le 29 juillet 2026 dans les deux listes publiées par la DGFiP, qui comptent 148 plateformes immatriculées : Indy, Abby, Shine, Tiime, Pennylane, Qonto et Dougs y figurent, Freebe non. C’est une solution compatible, adossée à la plateforme agréée d’un tiers. Ce n’est pas disqualifiant en soi, mais la question à poser devient « qui paye le raccordement », et elle est développée dans notre guide du logiciel de facturation électronique conforme.

Indy : imbattable en BNC au réel, hors jeu à l’international

Indy est le seul du comparatif à produire et télétransmettre la liasse 2035 pour un prix raisonnable : 28 € HT par mois sur le plan Premium en entreprise individuelle au réel, soit 22 € en paiement annuel. À comparer aux quelque 150 € HT par mois qu’un cabinet facture pour la tenue, la TVA et la 2035, soit près de 1 800 € l’année d’après notre relevé des prix d’un expert-comptable. L’écart est net, à condition d’accepter d’être autonome.

Attention à un détail de grille que les comparateurs ratent systématiquement : le prix du plan Premium dépend de votre structure juridique. 19 € en micro, 28 € en entreprise individuelle au réel, 32 € en SCI ou LMNP, et 59 € en SASU, SARL ou EURL. Le « 49 € » que vous verrez affiché pour une société est le tarif annualisé, pas le mensuel.

Sa limite est nommée, et elle est sévère pour ce métier : pas de devises étrangères. Un consultant qui facture un client londonien en livres devra tenir ce compte ailleurs. Notre avis complet sur Indy détaille le reste.

Pennylane : le seul qui tienne la route à l’international

Pennylane est le choix par défaut du consultant en société, et le seul du comparatif à convertir automatiquement une facture en devise étrangère au taux du jour. Son module analytique, disponible dès le plan Essentiel à 24 € HT, permet de rattacher recettes et dépenses à une mission et de voir la marge réelle. C’est exactement ce qui manque à un consultant au forfait.

Deux réserves. Le plan qui contient la comptabilité complète et la liasse en EDI est à 79 € HT par mois, ce qui n’a plus rien à voir avec les tarifs d’Indy. Et l’éditeur pose lui-même sa frontière : la comptabilité d’une entité étrangère n’est pas prise en charge. Facturer à l’étranger, oui ; avoir une structure à l’étranger, non. Voyez notre avis Pennylane et notre comparatif Indy vs Pennylane.

Abby : parfait pour démarrer, à quitter en grandissant

À 9 € HT par mois, avec un plan gratuit réellement utilisable, Abby est le meilleur rapport qualité-prix tant que vous restez au micro-BNC. Facturation illimitée conforme, livre des recettes automatique, estimation des cotisations, alertes de seuil.

Sa limite est structurelle et l’éditeur l’assume : l’outil est fait pour la micro-entreprise. Pas de 2035, pas de comptabilité d’engagement, et la facturation en devise seulement sur le plan Business à 33 €. Le jour où vous passez au réel ou en société, vous changez d’outil.

Notre note pour un consultant indépendant

Et la facturation électronique ?

L’échéance tombe dans quelques semaines et elle vous concerne, quel que soit votre régime.

Échéance	Qui est concerné	Ce qui devient obligatoire
1er septembre 2026	tous les assujettis, vous compris	recevoir des factures électroniques
1er septembre 2026	grandes entreprises et ETI	émettre
1er septembre 2027	TPE, PME et micro-entreprises	émettre

Dès la rentrée, vos fournisseurs professionnels vous factureront par voie électronique, ce qui suppose d’être raccordé à une plateforme agréée.

Un piège vaut d’être signalé pour ce métier, parce qu’il touche les consultants montés en holding : la catégorie de taille s’apprécie au 1er janvier 2025, et une société membre d’un assujetti unique, c’est-à-dire d’un groupe TVA, perd le report. Elle doit émettre dès le 1er septembre 2026, même petite.

Bonne nouvelle : Indy, Pennylane et Abby sont des plateformes agréées et incluent la conformité sans supplément, plan gratuit compris.

Notre verdict, par profil

Vous démarrez, au micro-BNC, clients français. Le plan gratuit d’Abby suffit, et le plan Start à 9 € HT dès que vous voulez suivre votre seuil et estimer vos cotisations. Ne payez pas pour une comptabilité que vous n’avez pas à tenir.

Vous êtes en BNC à la déclaration contrôlée. Indy Premium à 28 € HT par mois, soit 264 € l’année. C’est le meilleur ratio du marché sur ce cas précis, et le seul à aller jusqu’au dépôt de la 2035. Réserve à lever avant de signer : vérifiez que vous ne facturerez pas en devise.

Vous êtes en société à l’IS. Pennylane, à partir du plan Essentiel si votre expert-comptable tient les écritures, en Premium si vous voulez la liasse en interne. Indy Premium société à 59 € HT est une alternative moins chère, mais sans analytique par mission ni multidevise.

Vous facturez régulièrement à l’étranger. Pennylane, sans hésiter, et la DES à la main tous les mois. Si le volume devient significatif, un expert-comptable en ligne coûte moins cher que la première erreur d’autoliquidation.

Vous refacturez beaucoup de frais. Quel que soit l’outil, tranchez d’abord la question débours ou frais refacturé, contrat par contrat. Aucun logiciel ne le fera à votre place, et c’est le point que l’administration regarde en premier.

FAQ

Quel est le meilleur logiciel de comptabilité pour un consultant indépendant ?

Indy dans la majorité des cas, parce qu’il est le seul à produire et télétransmettre la déclaration 2035 pour 28 € HT par mois en entreprise individuelle au réel. Deux exceptions nettes : au micro-BNC, Abby suffit à 9 € HT ou même en gratuit ; en société à l’IS ou avec des clients facturés en devise étrangère, Pennylane est le seul à tenir, Indy indiquant lui-même ne pas gérer les comptes en devises.

Un consultant doit-il facturer la TVA ?

Oui, dès que ses recettes dépassent 37 500 € sur l’année précédente, ou 41 250 € en seuil majoré en cours d’année, au titre de l’article 293 B du Code général des impôts. En dessous, il est en franchise en base et porte la mention « TVA non applicable, art. 293 B du CGI ». Attention à ne pas confondre ce seuil avec le plafond du micro-BNC, qui est de 83 600 € : on peut parfaitement rester au micro tout en facturant la TVA.

Comment refacturer des frais de mission à un client ?

De deux façons, qui n’ont pas le même traitement de TVA. Si vous avez engagé la dépense en votre nom, c’est un frais refacturé : il entre dans votre base de TVA et se refacture avec TVA, au titre de l’article 267, I-2° du CGI. Si la dépense a été engagée au nom et pour le compte du client, et si les trois conditions du 267, II-2° sont réunies, c’est un débours, exclu de la base de TVA. Ces trois conditions sont cumulatives : rendre compte au client, porter la dépense en comptes de passage, et pouvoir en justifier la nature et le montant exact.

Comment facturer un client dans l’Union européenne ?

Hors taxe, avec la mention « Autoliquidation » et les numéros de TVA intracommunautaire du prestataire et du client. L’article 259, 1° du CGI situe l’imposition chez le preneur assujetti, qui autoliquide la taxe dans son pays. S’y ajoute l’obligation de déposer une déclaration européenne de services, mensuelle et dématérialisée, prévue par l’article 289 B, III du CGI. Aucun des logiciels de ce comparatif ne la télétransmet à votre place.

Et un client hors Union européenne ?

La prestation sort du champ de la TVA française et se facture hors taxe. Aucune déclaration européenne de services n’est due : la DES ne concerne que les clients établis dans un autre État membre. En revanche, si vous êtes payé en devise étrangère, la question du logiciel se repose entièrement.

Un consultant en portage salarial a-t-il besoin d’un logiciel de comptabilité ?

Non. L’article L1254-1 du Code du travail fait du salarié porté un salarié de l’entreprise de portage, qui le rémunère. La comptabilité, les déclarations sociales et fiscales et le compte d’activité relèvent de l’entreprise de portage. Un consultant en portage n’a ni BNC ni BIC à déclarer, donc aucun logiciel de comptabilité à acheter.

Quand passer du micro-BNC à la déclaration contrôlée ?

Obligatoirement au-delà de 83 600 € de recettes. Volontairement, dès que vos charges réelles dépassent l’abattement forfaitaire de 34 % du micro-BNC. Pour un consultant qui loue un bureau, se déplace, sous-traite ou investit en matériel, ce seuil de 34 % est franchi bien avant le plafond. Le calcul mérite d’être refait chaque année.

Existe-t-il un logiciel de comptabilité gratuit pour un consultant ?

Oui pour la facturation, non pour les déclarations. Les plans gratuits d’Abby, d’Indy, de Tiime et le plan Micro de Pennylane permettent de facturer sans limite de durée et sont conformes à la facturation électronique. En revanche, la déclaration 2035, la comptabilité d’engagement et la liasse fiscale sont systématiquement payantes. Le gratuit couvre la facturation, pas la comptabilité déclarative.

Quel logiciel calcule la rentabilité d’une mission ?

Pennylane, via son module analytique disponible dès le plan Essentiel à 24 € HT par mois, qui permet de rattacher recettes et dépenses à une mission. Abby et Tiime proposent un suivi du temps passé. Indy ne documente pas la fonction. C’est un critère décisif si vous facturez au forfait, puisque c’est le seul moyen de savoir quel taux journalier vous avez réellement obtenu.

À lire aussi

• Avis Indy 2026 : test complet, tarifs et limites
• Avis Pennylane 2026 : le test complet
• Indy vs Pennylane : lequel choisir en 2026 ?
• Meilleur logiciel de comptabilité pour indépendant : comparatif 2026
• Logiciel de facturation électronique conforme : le guide 2026
• Notes de frais d’un indépendant : comment les gérer
• Prix d’un expert-comptable pour un indépendant

Transparence : cet article contient des liens d’affiliation. Si vous souscrivez via l’un de nos boutons, ccima.net perçoit une commission, sans surcoût pour vous. Cela n’influence pas notre analyse.